早年經歷
1999年11月10日，菲利克斯出生於葡萄牙的維塞烏區。由於菲利克斯的父親是一名足球體能師，所以菲利克斯從小就在父親的引導下接觸足球，並最終喜歡了這項運動。2007年，菲利克斯在父親的陪同下加入了位於通德拉的佩斯蒂尼亞斯少年足球隊。在加進球隊後，菲利克斯出眾的球技引得了來自波爾圖足球俱樂部球探的關注。
2008年，菲利克斯加入波爾圖足球俱樂部青訓營。在此之後，父親每天17時從家裡出發，送菲利克斯趕到波爾圖參加19時開始的訓練。然而到14歲時，由於身體瘦弱，菲利克斯被波爾圖青訓營淘汰。在被淘汰後，菲利克斯曾一度想放棄足球這項運動，但之後在父親的勸說和監督下，菲利克斯改變了想法，加入了帕多恩斯足球俱樂部U-17梯隊。2015年，菲利克斯又轉投至本菲卡足球俱樂部青訓系統。
運動生涯
俱樂部生涯
本菲卡時期
2015-16賽季，菲利克斯在本菲卡U-17梯隊出場27次，打進10球。緊接著在2016-17賽季中，菲利克斯升入了本菲卡U-19梯隊，並在該賽季獲得26場比賽中打進9球，幫助球隊奪得歐洲青年聯賽亞軍。這一系列的表現使得菲利克斯升入了本菲卡B隊，並獲得了跟隨本菲卡一線隊共同訓練的機會。
2017-18賽季，在本菲卡B隊，菲利克斯成為了本菲卡B隊歷史上年齡最小的球員，隨後在本菲卡B隊對陣維塞烏學院隊的葡甲聯賽中打進一記凌空抽射，成為葡甲聯賽最年輕的進球球員。在此期間，菲利克斯得到了時任B隊主教練布魯諾·拉格的賞識，在2017年11月與本菲卡足球俱樂部簽下了一份為期四年的續約契約。該賽季，菲利克斯代表本菲卡B隊在葡甲聯賽中出場17次，打進4球，助攻5次；在歐洲青年聯賽中出場5次，打進1球。 2018年，在2018-19賽季開始前，菲利克斯被提拔進本菲卡一線隊。8月18日，在葡超第2輪聯賽中，本菲卡以2比0戰勝博阿維斯塔足球俱樂部，菲利克斯在下半場第87分鐘獲得替補出場的機會，完成了一線隊處子秀。8月21日，在歐洲冠軍聯賽首回合資格賽中，本菲卡以1比1戰平塞薩洛尼基足球俱樂部，菲利克斯在下半場第80分鐘獲得替補出場的機會，完成歐戰首秀。8月25日，在葡超第3輪聯賽中，本菲卡以1比1戰平葡萄牙體育足球俱樂部，菲利克斯在下半場第71分鐘替補出場，隨後在下半場第86分鐘打進扳平比分的一球，同時也是一線隊處子球。11月，菲利克斯與本菲卡足球俱樂部達成續約協定，雙發續約至2023年。2019年1月，在布魯諾·拉格成為本菲卡主教練後，菲利克斯被提拔為主力球員。3月2日，在葡超第24輪的國家德比中，本菲卡以2比1逆轉戰勝波爾圖，菲利克斯在上半場第26分鐘幫助球隊扳平比分。4月11日，在歐足聯歐洲聯賽第一回合四分之一決賽中，本菲卡以4比2戰勝法蘭克福足球俱樂部，菲利克斯主導了本隊的四粒進球，上演了帽子戲法，並為隊友送出一次助攻，19歲5個月零2天的菲利克斯成為歐足聯歐洲聯賽歷史上演帽子戲法最年輕的球員，同時打破了前輩尤西比奧創下的記錄，成為葡萄牙足球歷史上在歐戰中上演帽子戲法最年輕的球員。2018-19賽季，菲利克斯代表本菲卡在各項賽事中出場43次，打進20球，助攻11次，入選葡超賽季最佳陣容、歐足聯歐洲聯賽最佳陣容。
馬德里競技時期
2019年7月，菲利克斯以1.26億歐元的轉會費，從本菲卡轉會至西甲馬德里競技足球俱樂部，雙方簽約7年，這一費用不僅打破了馬德里競技足球俱樂部的隊史轉會費記錄，而且菲利克斯還超越了克里斯蒂亞諾·羅納爾多的轉會費記錄，成為身價最高的葡萄牙球員。
2019年7月21日，在馬德里競技3比0戰勝努曼西亞足球俱樂部的熱身賽中，菲利克斯身披7號球衣首發出場，完成了馬德里競技首秀，但在上半場第28分鐘，菲利克斯因傷提前退場。8月11日，在斯德哥爾摩舉行的國際冠軍杯歐洲區比賽中，馬德里競技以2比1戰勝尤文圖斯足球俱樂部，菲利克斯在比賽中中梅開二度。8月18日，在西甲首輪聯賽中，馬德里競技以1比0戰勝赫塔菲足球俱樂部，菲利克斯曾在下半場第56分鐘為球隊贏得一粒點球，但隨後隊友阿爾瓦羅·莫拉塔將球罰失。12月，菲利克斯榮膺歐洲金童獎。  國家隊生涯
2017年7月，菲利克斯被召入葡萄牙U-17國家隊，此後菲利克斯在2017年又跳級升入了葡萄牙U-20國家隊。除此之外，菲利克斯還在2018年代表葡萄牙U-19國家隊參加了兩場比賽。
2019年5月，菲利克斯首次入選葡萄牙國家男子足球隊。6月5日，在歐洲國家聯賽半決賽中，葡萄牙以3比1戰勝瑞士晉級決賽，菲利克斯在比賽中獲得首發出場的機會，完成了國家隊首秀。6月9日，在歐洲國家聯賽決賽中，葡萄牙以1比0戰勝荷蘭奪得冠軍，菲利克斯進進球隊大名單，但沒有獲得出場機會。
2020年8月24日，葡萄牙足協公布新一期25人大名單，若昂·菲利克斯入選。