1990年黃秋生在無線電視已是一線演員，出演過電視劇有《小小大丈夫》、《午夜太陽》、《特警90》等等。在無線時期黃秋生認識了不少合作夥伴，包括當時為監製的杜琪峯、演員劉青雲、吳鎮宇等等。

1993年《八仙飯店之人肉叉燒包》，黃秋生在該片中飾演變態殺人犯，但他憑藉該片贏得香港電影金像獎最佳男主角。

1996年黃秋生出演《伊波拉病毒》，該片是一部由王晶監製，邱禮濤執導的電影。

1998年在《野獸刑警》中黃秋生飾演的是位腳踏兩條船的邊緣警察，該片不僅獲得第18屆香港電影金像獎，黃秋生演藝表現和精湛演技也再次獲得肯定，黃秋生也獲得了最佳男主角的個人榮譽。

2003年黃秋生在《無間道》一片裡飾演性格正直的警官，該片贏得了台灣電影金馬獎最佳男配角。

2005年黃秋生更憑著《頭文字D》飾演藤原文太再贏得香港電影金像獎最佳男配角。

2007年黃秋生參與了由周杰倫第一次導演的作品《不能說的秘密》，在本片裡兩人再次以父子的面目出現。該片也獲得了第44屆金馬影展年度台灣傑出電影獎。

2008年黃秋生參演了由李國立執導的電視劇《射鵰英雄傳》。

2011年黃秋生與黃奕再度合作拍攝《競雄女俠秋瑾》，黃秋生飾演秋瑾的朋友李宗岳，他是清廷的一位官僚，卻一直力挺秋瑾，在親自監斬了秋瑾之後也選擇了自殺。黃秋生也憑藉著該片獲得第3屆澳門國際電影節最佳男配角。

2013年黃秋生主演了電影《葉問：終極一戰》，講述了葉問後半生的故事。黃秋生雖然已經51歲了，但仍認認真真學習了詠春拳，黃秋生在片中耍的詠春除了黐手、八斬刀等之外，還要耍一下棍法。黃秋生的葉問也帶出了影片中葉問中年時期的感覺，就有滄桑感又有穩重之感。 黃秋生憑藉這部《葉問:終極一戰》獲得第5屆澳門國際電影節最佳男主角。

2015年，參演電影《十二金鴨》。